新的检验体例首要流程囊括前置功课、海关查验系统现场检验、归纳措置、后置功课。满堂海闭检验功课囊括检验指令下达、检验移箱功课、机查抄验功课、人工检验功课、检验分外措置等五大模块性能。体例将原有的海闭和检讨检疫检验重叠功课闭节举行了优化整合，告竣了海闭与检讨检疫的一次布控和一次检验，同时该体例设备了后续措置的功课模块，能够对分外环境分类举行后续措置等操作。
“机检+人工”检验是新体例中新显露的一种检验形式。过去机查抄验便是海闭行使大型集装箱查抄设置对集装箱装载物品举行扫描成像，通过图像阐述判别实货与申报是否相符的检验技能。因以往海闭实践的机查抄验不必要开箱查抄，海关查验系统正在海闭与检讨检疫的检验任务兼并后，看待检讨检疫的检验，则必需对局限商品实践开箱检验。因而，海闭看待此类检验实践预设指令，也便是对被布控的物品局限集装箱也许必要机检，海关查验系统局限集装箱也许必要直接人工。当然，正在海闭通过机查抄验的流程中，以为物品有私运违规嫌疑的，也能够连续转人工检验。
新检验体例实践后，企业应当防备海闭的“”港口事中”和“主意地事中”的检验指令是差异的。“港口事中”指令是海闭卡口放行前实践的，首要针对安静准入或税收危急闭联的物品检验，布控后，物品暂不予放行，简单窗口有检验报告，无放行音信，港区EDI体例有检验指令。可能正在港区内的检验地方竣工一概检验功课的，根据新一代检验拘束体例操作手册及闭联功课类型实践检验、办结检验手续。如无法正在港区内的检验地方竣工一概检验功课的，必要通过转场形式，告竣检验分流，将物品转变至港外的检验地方实践，正在新一代检验拘束体例注册检验结果、办结检验手续。“港口事中”指令是海闭卡口放行前实践的，首要针对安静准入或税收危急闭联的物品检验，布控后，物品暂不予放行，简单窗口有检验报告，无放行音信，港区EDI体例有检验指令。可能正在港区内的检验地方竣工一概检验功课的，根据新一代检验拘束体例操作手册及闭联功课类型实践检验、办结检验手续。如无法正在港区内的检验地方竣工一概检验功课的，必要通过转场形式，告竣检验分流，将物品转变至港外的检验地方实践，正在新一代检验拘束体例注册检验结果、办结检验手续。海关查验系统“主意地事中”指令只针对进口物品，是海闭放行后实践的，针对及格入市为主的物品检验，轻触开关，布控同时，物品可卡口放行。简单窗口收到放行音信，港区EDI体例没有检验指令。企业可选取前去主意地实践检验，也可向港口检验部分申请检验。看待仅射中“主意地事中”检验指令的物品，可正在港口提离后，由企业自行运输至对应主意地，根据新一代检验拘束体例操作手册及闭联功课类型实践检验、办结检验手续。
这两个检验指令条件企业不行显露申报纰谬，加倍是必要检讨检疫的物品，假如物品是必要去主意检讨的，要无误申报主意地检讨检疫组织，以便于指令能够凿凿的分发到相应的海闭检验部分。看待仅射中“主意地事中”检验指令的物品，可正在港口提离后，由企业自行运输至对应主意地，相干主意地海闭实践检验、办结检验手续。